Evolutionär genomik

Nivå:	Avancerad nivå
Kurskod:	1BG317
Poäng:	15 hp
Övrigt:	Kursplan
Schema och kursmaterial:	Schema Studium

För att förstå hur variation på DNA nivå översätts till adaptiv variation på individnivå, krävs en kombination av populationsgenetik och funktionsgenomik, vilket avspeglas i kursens mål. Kursen avser att ge en fördjupad kunskap och förståelse om populationsgenetiska frågeställningar samt principer och arbetsmetoder inom funktionsgenomik. Tyngdpunkter ligger på applikationer inom organism- och genomevolution, naturvårdsbiologi och biodiversitetsforskning. Kursen ger träning i att planera, genomföra, utvärdera och redovisa problembaserade projektarbeten, där studenterna genomför ett verkligt forskningprojekt från början (planering) till slut (presentation av resultat).

Kursens innehåll:

• Evolutionär genetik: teorin utveckling, de grundläggande evolutionära faktorerna (mutation, drift, selektion, rekombination).
• Genetisk diversitet: genetisk variation inom och mellan populationer, gene-genealogier (drift och coalescent), spridning och genflöde, populationstruktur, ”linkage disequilibrium”, inavel och inavelsdepression, bevarandegenetik, analys av DNA-sekvenser, jämförande metoder.
• Kvantitativ genetik: kvantitativ genetik i naturliga och experimentella populationer, molekylär bakgrund till kvantitativ variation (QTL).
• Jämförande genomik: genomevolution, överföring av information från modellorganismer.
• Functionsgenomik: Identifiering av gener som påverkar adaptiva egenskaper (QTL kartering, associations-kartering, SNPs, genuttryck, ”forward” och ”reverse genetics”), genreglering i fenotypisk variation och evolution.

Undervisningen ges i form av föreläsningar, laborationer, seminarier, datorövningar, litteraturuppgifter och projektarbeten. Deltagande i laborationer, datorövningar, litteraturuppgifter och projektarbeten är obligatoriskt. Föreläsningar ges på engelska och andra delar ges på svenska eller engelska beroende på kursdeltagarna.